Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPCSQ9HAB8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPCSQ9HAB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms