Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RNF39Q9H2S5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF39Q9H2S5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF39Q9H2S5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms