Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM60Q9H2L4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM60Q9H2L4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM60Q9H2L4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms