Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM55Q9BYV6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM55Q9BYV6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms