Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RNF17Q9BXT8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RNF17Q9BXT8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RNF17Q9BXT8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RNF17Q9BXT8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RNF17Q9BXT8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms