Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF7

CRB3, Protein crumbs homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB3Q9BUF7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRB3Q9BUF7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB3Q9BUF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB3Q9BUF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB3Q9BUF7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms