Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NDUFAF3Q9BU61 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NDUFAF3Q9BU61 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFAF3Q9BU61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms