Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM43Q9BTV4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM43Q9BTV4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM43Q9BTV4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms