Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRFN3Q9BTN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRFN3Q9BTN0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRFN3Q9BTN0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms