Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CGRRF1Q99675 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CGRRF1Q99675 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms