Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms