Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALPK1Q96QP1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALPK1Q96QP1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALPK1Q96QP1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms