Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOPNLQ96NB1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOPNLQ96NB1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOPNLQ96NB1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOPNLQ96NB1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOPNLQ96NB1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOPNLQ96NB1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOPNLQ96NB1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOPNLQ96NB1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOPNLQ96NB1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms