Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CMTM3Q96MX0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMTM3Q96MX0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMTM3Q96MX0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMTM3Q96MX0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMTM3Q96MX0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CMTM3Q96MX0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CMTM3Q96MX0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CMTM3Q96MX0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms