Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 432.7 ms