Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
USP47Q96K76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
USP47Q96K76 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
USP47Q96K76 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms