Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OTUB1Q96FW1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTUB1Q96FW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUB1Q96FW1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms