Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MS4A6EQ96DS6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A6EQ96DS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms