Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
RUNDC1Q96C34 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
RUNDC1Q96C34 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
RUNDC1Q96C34 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RUNDC1Q96C34 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms