Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BHMTQ93088 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BHMTQ93088 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms