Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TNPO1Q92973 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TNPO1Q92973 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TNPO1Q92973 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNPO1Q92973 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms