Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHBDD1Q8TEB9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHBDD1Q8TEB9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms