Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZD8Q8NEN9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PDZD8Q8NEN9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZD8Q8NEN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PDZD8Q8NEN9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PDZD8Q8NEN9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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