Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC44A5Q8NCS7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC44A5Q8NCS7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC44A5Q8NCS7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms