Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD9Q8NBP5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MFSD9Q8NBP5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms