Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNTD1Q8N9Z9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMNTD1Q8N9Z9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD1Q8N9Z9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms