Protein–RNA interactions for Protein: Q8N394

TMTC2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC2Q8N394 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMTC2Q8N394 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMTC2Q8N394 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMTC2Q8N394 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms