Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00269Q8N2A0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00269Q8N2A0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms