Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC105Q8IYK2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC105Q8IYK2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC105Q8IYK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms