Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C9orf40Q8IXQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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C9orf40Q8IXQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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C9orf40Q8IXQ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf40Q8IXQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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