Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHOT1Q8IXI2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RHOT1Q8IXI2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHOT1Q8IXI2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms