Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC22A9Q8IVM8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A9Q8IVM8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A9Q8IVM8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms