Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC71Q8IV32 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC71Q8IV32 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms