Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAB11FIP4Q86YS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB11FIP4Q86YS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB11FIP4Q86YS3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAB11FIP4Q86YS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms