Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB9

PATL1, Protein PAT1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL1Q86TB9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PATL1Q86TB9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PATL1Q86TB9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms