Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FGD6Q6ZV73 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD6Q6ZV73 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
FGD6Q6ZV73 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FGD6Q6ZV73 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
FGD6Q6ZV73 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
FGD6Q6ZV73 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms