Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SFTA2Q6UW10 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTA2Q6UW10 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms