Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKN3Q6P5Z2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKN3Q6P5Z2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKN3Q6P5Z2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms