Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
H3F3CQ6NXT2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3F3CQ6NXT2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H3F3CQ6NXT2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms