Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RWDD4Q6NW29 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RWDD4Q6NW29 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RWDD4Q6NW29 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms