Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102BQ68D86 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102BQ68D86 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC102BQ68D86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC102BQ68D86 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms