Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
USPL1Q5W0Q7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
USPL1Q5W0Q7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USPL1Q5W0Q7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USPL1Q5W0Q7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USPL1Q5W0Q7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms