Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLX4IPQ5VYV7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLX4IPQ5VYV7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLX4IPQ5VYV7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms