Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIVEP3Q5T1R4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HIVEP3Q5T1R4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HIVEP3Q5T1R4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms