Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KCNT1Q5JUK3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNT1Q5JUK3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNT1Q5JUK3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNT1Q5JUK3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms