Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO1Q5FBB7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SGO1Q5FBB7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SGO1Q5FBB7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms