Protein–RNA interactions for Protein: Q3MJ16

PLA2G4E, Cytosolic phospholipase A2 epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4EQ3MJ16 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLA2G4EQ3MJ16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PLA2G4EQ3MJ16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PLA2G4EQ3MJ16 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms