Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NBPF1Q3BBV0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NBPF1Q3BBV0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NBPF1Q3BBV0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NBPF1Q3BBV0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms