Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SGSM1Q2NKQ1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSM1Q2NKQ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGSM1Q2NKQ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
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