Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LAMA3Q16787 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMA3Q16787 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMA3Q16787 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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