Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC18A3Q16572 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A3Q16572 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A3Q16572 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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